ODHB FN Brno má zaveden program pro řízení kvality v souladu se strategickými záměry FN Brno, s koncepcí oboru hematologie a biochemie a s legislativními požadavky.
Hematologická laboratoř je od 15. 11. 2012 akreditována ČIA dle ISO 15189:2007 pod číslem 8212. Akreditované metody jsou označeny v Laboratorní příručce ODHB a v Seznamu laboratorních metod hvězdičkou a písmenem A (" *A "), na výsledkovém listu pak hvězdičkou " * " před názvem vyšetření. Hematologická laboratoř má již dlouhodobě zaveden vlastní široký program řízení vnitřních kontrol kvality pro jednotlivá vyšetření a pravidelně se účastní systému externího hodnocení kvality jak na národní (SEKK - systém externí kontroly kvality), tak mezinárodní úrovni (CAP -College of American Pathologists). Certifikáty/Osvědčení o účasti, které jsou vydávány na základě správnosti provedených analýz, jsou potom dokladem k oprávnění provádění příslušných vyšetření. Biochemická laboratoř ODHB je akreditovaná od 28. 11. 2008 ČIA dle ISO 15189:2007 pod číslem 8060. Od 5. 9. 2016 opakovaná akreditace ČIA dle ISO 15189:2013 pod č. 8060. Akreditované metody jsou označeny v Laboratorní příručce ODHB a v Seznamu laboratorních metod hvězdičkou a písmenem A (tj. " * A "), na výsledkovém listu pak hvězdičkou (" * ") před názvem metody.
V listopadu 2020 laboratoře ODHB úspěšně absolvovaly reakreditaci ČIA dle ISO 15189:2013 již společně pod č. 8212.