Centrum molekulární biologie a genetiky je subjektem akreditovaným dle ČSN EN ISO 15189:2013.
Úroveň práce a kvalita vyšetřovacích metod je sledována externí kontrolou kvality a systémem operačního řízení vnitřní kontroly kvality. V současné době jsme zapojeni do následujících systémů externí kontroly kvality: EMQN (The European Molecular Genetics Quality Network, http://www.emqn.org/emqn/Home), UK NEQAS (United Kingdom National External Quality Assessment Service) for molecular genetics (www.ukneqas-molgen.org.uk) a UK NEQAS for Leucocyte Immunophenotyping (www.ukneqasli.co.uk), QCMD (Quality Control for Molecular Diagnostics) a SEKK (www.sekk.cz) a mezilaboratorní porovnání (organizované ÚHKT a Bioptickou laboratoří s.r.o. v Plzni) v nichž námi dosahovaná kvalita stanovení má velmi dobrou úroveň.
V oblasti vyšetřování prediktivních znaků u solidních nádorů CMBG získalo statut referenční laboratoře prediktivní onkologie.
