Bakteriologie, mykologie, parazitologie
· Běžně požadovaná vyšetření jsou parametricky uvedena v žádance BAKTERIOLOGIE (aktuální na webu ÚLM-OKMI), požadavek na v žádance neuvedená prováděná vyšetření je možné uvést do kolonky „doplňující informace“ případně v kombinaci s „materiál jiný“.
· Statimová vyšetření prováděná mimo standardní pracovní dobu ÚLM-OKMI na pracovišti ÚLM-CEMULA (ÚLM-OKB, pavilon CH) jsou uvedena v žádance MIKROBIOLOGIE STATIM – viz C.03 Požadavky na statimová vyšetření
· Níže uvedený přehled vyšetření je rámcový. Aktuálně prováděná bakteriologická vyšetření včetně typu vyšetřovaného materiálu najdete v Příloze 2 LP (Přehled mikrobiologických vyšetření a vyšetřovaných patogenů) a podrobněji pak v Příloze 5 LP (Informace k vyšetřením OKMI).
Bakteriologie (žádanka BAKTERIOLOGIE)
Kultivace běžná aerobní a anaerobní
· stěry a výtěry - z krku, nosu, ucha, oka, z rekta , z kůže, z rány, z uretry, z pochvy, hrdla děložního, z tělesných dutin, stěry z prostředí, z povrchů
· moč, hnis, likvor, punktát, ascites, dialyzát, žluč, mateřské mléko
· otisky z popálených ploch
· tkáň na drcení, kontaktní čočky, roztok na čočky, nitroděložní tělísko
· seškrab z rohovky
· katetry, cévky, drény
· sputum, tracheální aspirát, materiál z bronchoalveolární laváže, aspirát ze subglotického prostoru
· hemokultivace
Kultivace obligátních střevních patogenů
Kultivace Neisseria gonorrhoeae
Monitorace bakteriálního osídlení (screening VRE, MRSA, ESBL, MBL, KPC)
Předporodní screening Streptococcus agalactiae
Průkaz Ureaplasma spp. a Mycoplasma hominis
Průkaz antigenu Streptococcus pneumoniae z likvoru a moče
Průkaz antigenu Legionella sp. z moče
Průkaz Trichomonas vaginalis
Kultivace Helicobacter pylori, Průkaz antigenu Helicobacter pylori ze stolice
Průkaz antigenu a toxinu Clostridium difficile
Průkaz rotavirů, adenovirů a norovirů
Mikroskopické vyšetření na TBC
Kultivace Bordetella pertusis, Bordetella parapertussis
Kvalitativní stanovení citlivosti na antibiotika pomocí diskové difuzní metody
Kvantitativní stanovení citlivosti na antibiotika – minimální inhibiční koncentrace
Fenotypový průkaz karbapenemáz – KPC, OXA, VIM, IMP, NDM
Sterilita transfuzních přípravků
Sterilita roztoků, předmětů a tkání
Parazitologie (žádanka BAKTERIOLOGIE)
Průkaz střevních parazitů
Průkaz vajíček roupů
Průkaz krevních a tkáňových parazitů
Kultivace akantaméb
Průkaz vajíček schistosom v moči
Determinace ektoparazitů
Tasemnice, červi – determinace
Průkaz G. intestinalis v duodenální šťávě
Jiný biologický materiál na parazity – sputum, punktát
Mykologie (žádanka BAKTERIOLOGIE)
Kultivace na kvasinky/plísně
Průkaz Cryptococcus sp.
Průkaz antigenu Aspergillus sp.
Průkaz panfungálního antigenu
Dermatofyta
Molekulární mikrobiologie / PCR (žádanka MOLEKULÁRNÍ MIKROBIOLOGIE)
· Níže uvedený přehled vyšetření je rámcový. Veškerá aktuálně prováděna vyšetření (po jednotlivých patogenech a po vyšetřovacích panelech) jsou uvedena v žádance MOLEKULÁRNÍ MIKROBIOLOGIE (aktuální na webu ÚLM-OKMI).
· Statimová vyšetření prováděná mimo standardní pracovní dobu ÚLM-OKMI na pracovišti ÚLM-CEMULA (ÚLM-OKB, pavilon CH) jsou uvedena v žádance MIKROBIOLOGIE STATIM – viz C.03 Požadavky na statimová vyšetření
· Aktuálně prováděná vyšetření (jednotlivé patogeny) včetně typu vyšetřovaného materiálu najdete v Příloze 2 LP (Přehled mikrobiologických vyšetření a vyšetřovaných patogenů) a podrobněji pak v Příloze 5 LP (Informace k vyšetřením ÚLM-OKMI).
Bakteriální meningitidy (vč. Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae b, Listeria monocytogenes, E. coli K1).
Virové meningitidy (vč. Enterovirus sp., Parvovirus B19, Parotitis, Parechovirus (HPeV), Adenovirus, Herpesviry).
Respirační patogeny (vč. Influenzavirus A, Influenzavirus B, RS virus, SARS-CoV-2, Metapneumovirus, Parainfluenza, Adenovirus, Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis, B. parapertussis, Chlamydophila pneumoniae, Haemophilus influenzae, Aspergillus spp. Mycobacterium tuberculosis).
STD (Herpesviry, HPV high risk, HPV low risk, Chlamydia trachomatis + sérovary L1-L3, Treponema pallidum, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma, Ureaplasma, Haemophilus ducreyi).
Herpesviry: EBV (kvantitativně, kvalitativně), CMV (kvantitativně, kvalitativně), VZV, HSV1,2, HHV 6, HHV 7.
Hepatitidy: HBV kvantitativně, HCV kvantitativně, HCV genotypizace, HEV, HAV.
Arboviry: Virus Dengue, Virus Zika, Virus Žluté horečky, Virus Chikungunya, Virus Zapadonilské horečky
Gastroenteritidy virové (Adenovirus, Rotavirus, Norovirus, Astrovirus, Sapovirus).
Gastroeneteritidy bakteriální (vč. Salmonella spp., Campylobacter spp., Clostridium difficile + hypervirulentní ribotyp, Vibrio spp., E. coli, Yersinia enterocolitica, Aeromonas spp., Plesiomonas shigelloides).
Gastroeneteritidy parazitární (vč. Giardia intestinalis, Entamoeba histiolytica, Cryptosporidium spp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis).
Ostatní: JCV, Toxoplasma gondii, Morbilli, MRSA, Borrelia burgdorferi s.l., Francisella tularensis, Anaplasma sp., Leptospira spp., Monkeypoxvirus, HIV-1 kvalitativně, kvantitativně
Mycobacterium spp.: Netuberkulozní mykobakterie, Mycobacterium tuberculosis, Rezistence k Rifampicinu a Isoniazidu u Mycobacterium tuberculosis
Genetický průkaz karbapenemáz – KPC, OXA, VIM, IMP, NDM
Infekční imunologie (žádanka INFEKČNÍ IMUNOLOGIE)
· Níže uvedený přehled vyšetření je rámcový. Veškerá aktuálně prováděna vyšetření jsou uvedena v žádance INFEKČNÍ IMUNOLOGIE (aktuální na webu ÚLM-OKMI).
· Statimová vyšetření prováděná mimo standardní pracovní dobu ÚLM-OKMI na pracovišti ÚLM-CEMULA (ÚLM-OKB, pavilon CH) jsou uvedena v žádance MIKROBIOLOGIE STATIM – viz C.03 Požadavky na statimová vyšetření
· Aktuálně prováděná vyšetření (jednotlivé patogeny) včetně typu vyšetřovaného materiálu najdete v Příloze 2 LP (Přehled mikrobiologických vyšetření a vyšetřovaných patogenů) a podrobněji pak v Příloze 5 LP (Informace k vyšetřením ÚLM-OKMI).
Protilátky, antigeny, buněčná imunita:
Virové hepatitidy (protilátky, antigeny): HAV, HBV, HCV, HDV, HEV
Klíšťaty přenášené patogeny: Borrelia burgdorferi sensu lato vč. intratekální syntézy protilátek a stanovení CXCL-13, Virus klíšťové encefalitidy, Anaplasma phagocytophilum
Antropozoonózy: Bartonella henselae, Francisella tularensis, Toxoplasma gondii, Toxocara canis
Herpetické viry: HSV 1,2, CMV, EBV, HHV-6, VZV
Respirační viry: Influenzavirus A, Influenzavirus B, RS virus, Adenovirus, SARS-CoV-2
Chlamydie a respirační bakterie: Chlamydophila pneumoniae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma pneumoniae, Bordetella pertusis, Bordetella parapertussis
STD: HIV 1,2, Treponema pallidum, RPR, vč. intratekální syntézy anti-TP protilátek
Ostatní: Parvovirus B19, Enterovirus sp., Listeria monocytogenes, Helicobacter pylori, Yersinia enterocolitica O3, O9, Y. pseudotuberculosis, Campylobacter jejuni, Salmonella, Virus parotitidy, Virus zarděnek, Virus spalniček, Pseudomonas aeruginosa IgG
Postvakcinační: Haemophilus influenzae, Corynebacterium diphtheriae, Streptococcus pneumoniae, Clostridium tetani, Virus parotitidy, Virus zarděnek, Virus spalniček
Buněčná imunita: IGRA – TBC
MRZH reakce (intratekální syntéza protilátek IgG proti viru Morbilli, Rubeola, VZV, HSV)
Imunopatologie (žádanka IMUNOPATOLOGIE)
· Níže uvedený přehled vyšetření je rámcový. Veškerá aktuálně prováděna vyšetření jsou uvedena v žádance IMUNOPATOLOGIE (aktuální na webu ÚLM-OKMI).
· Aktuálně prováděná vyšetření jsou podrobně popsána v Příloze 5 LP (Informace k vyšetřením ÚLM-OKMI).
Autoimunity:
Protilátky proti strukturám buněčného jádra a cytoplazmy: Antinukleární protilátky ANA, ANCA, Protilátky proti proteináze 3 (PR3) IgG, Protilátky proti myeloperoxidáze (MPO) IgG, Protilátky proti ds a ss DNA IgG, Protilátky proti DNP IgG, Protilátky proti nukleosomům IgG, Protilátky
proti histonům IgG, Protilátky proti extrahovatelným jaderným antigenům (ENA screen + Ro (Ro-52/Ro-60), La, Sm, RNP, Scl-70, Jo-1, centromera, DFS-70 IgG).
Protilátky proti fosfolipidům: Protilátky proti kardiolipinu IgA, IgG, IgM, Protilátky proti beta2 glykoproteinu IgA, IgG, IgM, Protilátky proti annexinu V IgG, IgM. Protilátky proti doméně I beta2 glykoproteinu, Protilátky proti komplexu fosfatidylserin/protrombin IgG, IgM.
Autoimunitní onemocnění jater, žaludku a ledvin: Protilátky proti mitochondriím IgG; Protilátky proti mikrozomům jater a ledvin IgG; Protilátky proti hladkému svalstvu IgG; Protilátky proti parietálním buňkám IgG; Protilátky proti vnitřnímu faktoru IgG; Protilátky proti PLA2R; Protilátky proti bazální membráně glomerulů; Protilátky u autoimunitních hepatitid (AMA-M2, M2-3E, Sp100, gp210, LKM-1, LC-1, SLA/LP, Ro-52).
Potravinová intolerance: Protilátky proti deamidovanému gliadinu IgA, IgG; Protilátky proti tkáňové transglutamináze IgA, IgG; Protilátky proti endomyziu IgA, IgG; Protilátky proti retikulinu IgA, IgG; Protilátky proti Saccharomyces cerevisiae IgA, IgG, Protilátky proti kravskému mléku IgA, IgG.
Dermatologický soubor: Protilátky proti intercelulární substanci kůže, Protilátky proti bazální membráně kůže, Protilátky proti desmogleinu 1, desmogleinu 3, Protilátky proti BP 180, BP 230.
Neurologický soubor: Paraneoplastické protilátky (anti-Hu, Yo, Ri, CV2, Amphiphysin, Ma2/Ta, SOX1, Tr, Zic4, GAD65, Recoverin, Titin), Protilátky u autoimunitních encefalitid (anti-NMDAR, AMPA1, AMPA2, CASPR2, LG1, GABARB1/B2), Protilátky proti aquaporinu-4 IgG (anti-AQP4) a Protilátky proti myelin oligodendrocytárnímu glykoproteinu IgG (anti-MOG), Protilátky proti acetylcholinovému receptoru IgG (anti-AChR) a Protilátky proti svalové tyrozinkináze IgG (anti-MuSK), Triplet neurodegenerace/Alzheimer (tTau protein, pTau protein a β-amyloid 1-42).
Cirkulující imunokomplexy
Anti-IgA
Buněčná imunita:
T-lymfocyty (CD3/4/8): CD3+/lymfo, CD4+/lymfo, CD8+/lymfo, CD4/CD8 poměr, T-lymfocyty, Th-lymfocyty, Tc-lymfocyty
Subpopulace lymfocytů (T/B/NK): CD45+, CD45low+, CD14+/leuko, CD19+/lymfo, CD3+/lymfo, CD4+/lymfo, CD8+/lymfo, CD16+/lymfo, CD56+/lymfo, CD4/CD8 poměr, T-lymfocyty, Th-lymfocyty, Tc-lymfocyty, NK-buňky, CD3+CD16+/CD56+ NKT-like
Regulační T-lymfocyty
Gamma-delta T-lymfocyty: gamma-delta T-lymfocyty, TCR Vg9, TCR Vd2
Efektorové/paměťové T-lymfocyty: CD4+ N, CD4+ CN, CD4+ EM, CD4+ TEM, CD8+ N, CD8+ CN, CD8+ EM, CD8+ TEM
RTE CD4+ lymfocyty
Aktivační znaky (HLA-DR, CD69): HLA-DR/mono, HLA-DR/CD4 lymfo, HLA-DR/CD8 lymfo, CD69+/CD3 lymfo, CD69+/CD4 lymfo, CD69+/CD8 lymfo, CD69/NK, CD69+/NKT-like
Subpopulace monocytů: CD14++CD16-/mono, CD14++CD16+/mono, CD14+CD16++/mono
Neuroblastom: CD45, CD81, CD56, GD2, DNA index
QuantiFERON Monitor (QFM) test
Alergologie:
ECP, tryptáza, celkové IgE
Specifické IgE – jednotlivé a směsi (antigeny viz žádanka)
Specifické IgE – komponenty (antigeny viz žádanka)
Specifické IgG4 (antigeny viz žádanka)
Specifické IgG (antigeny viz žádanka)
BAT test aktivace bazofilů (antigeny viz žádanka)
Léčba protilátkami:
Hladiny terapeutických protilátek a protilátek proti terapeutickým protilátkám/ADA (adalimumab, infliximab, ustekinumab, vedolizumab)
Další:
Gastrin, aldosteron, renin, kalprotektin ve stolici, pankreatická elastáza ve stolici, IgG, IgA, IgM, sIL-2R/sCD25, kalcitriol
